La chimica supramolecolare o, come definita da Jean-Marie Lehn, "la chimica oltre la molecola" è alla base dello sviluppo delle nanotecnologie. Il controllo delle interazioni intermolecolari che governa il riconoscimento molecolare ed il processo di autoassemblamento delle molecole su scala nanometrica è importante sia per la scienza dei materiali (sensori, conduttività , magnetismo, ottica non lineare, ecc.) sia per la biologia (legame recettore-proteina, riconoscimento enzima-substrato, ecc.). Il DSCF ha, in questo ambito, numerose linee di ricerca.